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自建房可以注册公司。只要房屋是合法的，并且产权明晰，能够提供相关的产权证明和营业场所证明，那么就可以在该地址注册公司。

不过，还需要考虑其他因素，如土地使用权的问题，如果自建房的土地性质是农村集体土地或者国有土地但未获得相关土地使用权证，那么在注册公司时可能会受到限制，在自建房注册公司之前，需要确保土地和房屋都是合法的，并且拥有相关的证件和证明。

信息仅供参考，建议咨询当地相关部门获取具体的信息和规定。